Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRF1P14222 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRF1P14222 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRF1P14222 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRF1P14222 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRF1P14222 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PRF1P14222 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRF1P14222 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRF1P14222 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRF1P14222 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRF1P14222 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRF1P14222 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRF1P14222 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRF1P14222 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PRF1P14222 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRF1P14222 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms