Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA4P13612 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms