Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms