Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEFHP12036 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEFHP12036 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEFHP12036 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEFHP12036 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEFHP12036 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEFHP12036 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEFHP12036 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEFHP12036 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEFHP12036 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEFHP12036 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEFHP12036 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEFHP12036 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEFHP12036 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEFHP12036 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEFHP12036 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEFHP12036 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEFHP12036 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEFHP12036 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NEFHP12036 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NEFHP12036 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NEFHP12036 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEFHP12036 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEFHP12036 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEFHP12036 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEFHP12036 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEFHP12036 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEFHP12036 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEFHP12036 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms