Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms