Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GJB1P08034 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GJB1P08034 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJB1P08034 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJB1P08034 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJB1P08034 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJB1P08034 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GJB1P08034 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJB1P08034 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJB1P08034 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJB1P08034 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJB1P08034 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJB1P08034 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJB1P08034 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GJB1P08034 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms