Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX6O95503 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX6O95503 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX6O95503 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX6O95503 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX6O95503 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX6O95503 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX6O95503 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX6O95503 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX6O95503 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX6O95503 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX6O95503 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX6O95503 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX6O95503 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms