Protein–RNA interactions for Protein: O94972

TRIM37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM37O94972 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM37O94972 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM37O94972 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms