Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNKO75909 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNKO75909 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms