Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms