Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPFIA3O75145 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms