Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms