Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF3O43395 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms