Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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HOXA2O43364 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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HOXA2O43364 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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HOXA2O43364 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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HOXA2O43364 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA2O43364 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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