Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSH5O43196 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 TTC32-201ENST00000333610 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSH5O43196 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 AC003991.1-203ENST00000591739 719 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSH5O43196 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 IL6-201ENST00000258743 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 NPM1P31-201ENST00000399021 764 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 AL731577.1-201ENST00000449984 830 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 ELL2P2-201ENST00000515135 694 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSH5O43196 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSH5O43196 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSH5O43196 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSH5O43196 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSH5O43196 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSH5O43196 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSH5O43196 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSH5O43196 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSH5O43196 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSH5O43196 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSH5O43196 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSH5O43196 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSH5O43196 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSH5O43196 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSH5O43196 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSH5O43196 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSH5O43196 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MSH5O43196 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSH5O43196 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSH5O43196 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms