Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms