Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP290O15078 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP290O15078 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP290O15078 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP290O15078 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP290O15078 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP290O15078 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP290O15078 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP290O15078 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP290O15078 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP290O15078 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP290O15078 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP290O15078 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP290O15078 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP290O15078 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP290O15078 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP290O15078 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP290O15078 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP290O15078 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP290O15078 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP290O15078 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP290O15078 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP290O15078 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP290O15078 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP290O15078 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP290O15078 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP290O15078 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP290O15078 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP290O15078 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP290O15078 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP290O15078 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP290O15078 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEP290O15078 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
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CEP290O15078 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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CEP290O15078 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP290O15078 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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