Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNMO15061 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNMO15061 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNMO15061 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNMO15061 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNMO15061 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNMO15061 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNMO15061 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNMO15061 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNMO15061 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNMO15061 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNMO15061 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNMO15061 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNMO15061 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNMO15061 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNMO15061 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNMO15061 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNMO15061 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNMO15061 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNMO15061 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNMO15061 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNMO15061 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNMO15061 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNMO15061 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNMO15061 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNMO15061 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNMO15061 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNMO15061 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNMO15061 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNMO15061 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNMO15061 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNMO15061 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNMO15061 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNMO15061 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNMO15061 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNMO15061 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNMO15061 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNMO15061 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNMO15061 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNMO15061 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNMO15061 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNMO15061 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNMO15061 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNMO15061 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNMO15061 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNMO15061 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNMO15061 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNMO15061 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNMO15061 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNMO15061 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNMO15061 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNMO15061 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNMO15061 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNMO15061 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNMO15061 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNMO15061 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNMO15061 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNMO15061 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNMO15061 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNMO15061 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNMO15061 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNMO15061 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNMO15061 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNMO15061 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNMO15061 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNMO15061 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNMO15061 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNMO15061 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNMO15061 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNMO15061 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNMO15061 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNMO15061 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNMO15061 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNMO15061 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNMO15061 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNMO15061 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNMO15061 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNMO15061 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms