Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms