Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F3O00716 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F3O00716 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F3O00716 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F3O00716 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F3O00716 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F3O00716 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F3O00716 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms