Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIEO00221 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIEO00221 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIEO00221 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIEO00221 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIEO00221 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIEO00221 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIEO00221 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIEO00221 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIEO00221 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIEO00221 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIEO00221 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIEO00221 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIEO00221 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIEO00221 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIEO00221 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIEO00221 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIEO00221 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIEO00221 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIEO00221 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIEO00221 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIEO00221 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIEO00221 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIEO00221 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIEO00221 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIEO00221 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIEO00221 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIEO00221 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIEO00221 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIEO00221 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIEO00221 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIEO00221 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIEO00221 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIEO00221 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIEO00221 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIEO00221 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIEO00221 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIEO00221 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIEO00221 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIEO00221 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIEO00221 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIEO00221 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIEO00221 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIEO00221 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms