Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QRK9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QRK9 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QRK9 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QRK9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QRK9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
J3QRK9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
J3QRK9 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
J3QRK9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
J3QRK9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms