Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms