Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms