Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U3KQV3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U3KQV3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U3KQV3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U3KQV3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U3KQV3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U3KQV3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U3KQV3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U3KQV3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U3KQV3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U3KQV3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U3KQV3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U3KQV3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U3KQV3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U3KQV3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U3KQV3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQV3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQV3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQV3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQV3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQV3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQV3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQV3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U3KQV3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U3KQV3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U3KQV3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U3KQV3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U3KQV3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U3KQV3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U3KQV3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U3KQV3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
U3KQV3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
U3KQV3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KQV3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KQV3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KQV3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KQV3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KQV3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KQV3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KQV3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KQV3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KQV3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KQV3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KQV3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KQV3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KQV3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KQV3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KQV3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KQV3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KQV3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KQV3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KQV3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KQV3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KQV3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KQV3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KQV3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KQV3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KQV3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KQV3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KQV3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KQV3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KQV3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KQV3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KQV3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KQV3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U3KQV3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U3KQV3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U3KQV3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U3KQV3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U3KQV3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U3KQV3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U3KQV3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U3KQV3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U3KQV3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U3KQV3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U3KQV3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
U3KQV3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
U3KQV3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U3KQV3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
U3KQV3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
U3KQV3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U3KQV3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U3KQV3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
U3KQV3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U3KQV3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U3KQV3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U3KQV3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KQV3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KQV3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KQV3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KQV3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KQV3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KQV3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KQV3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KQV3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KQV3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KQV3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KQV3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KQV3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KQV3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms