Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC23IPQ9Y6Y8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC23IPQ9Y6Y8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SEC23IPQ9Y6Y8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC23IPQ9Y6Y8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC23IPQ9Y6Y8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC23IPQ9Y6Y8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC23IPQ9Y6Y8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC23IPQ9Y6Y8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC23IPQ9Y6Y8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC23IPQ9Y6Y8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC23IPQ9Y6Y8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC23IPQ9Y6Y8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC23IPQ9Y6Y8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC23IPQ9Y6Y8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC23IPQ9Y6Y8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC23IPQ9Y6Y8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms