Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAD1L1Q9Y6D9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAD1L1Q9Y6D9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms