Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y657

SPIN1, Spindlin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN1Q9Y657 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPIN1Q9Y657 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIN1Q9Y657 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPIN1Q9Y657 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPIN1Q9Y657 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPIN1Q9Y657 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPIN1Q9Y657 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPIN1Q9Y657 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPIN1Q9Y657 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPIN1Q9Y657 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPIN1Q9Y657 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPIN1Q9Y657 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPIN1Q9Y657 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPIN1Q9Y657 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPIN1Q9Y657 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPIN1Q9Y657 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIN1Q9Y657 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIN1Q9Y657 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIN1Q9Y657 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIN1Q9Y657 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIN1Q9Y657 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIN1Q9Y657 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIN1Q9Y657 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIN1Q9Y657 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIN1Q9Y657 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms