Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TIMM9Q9Y5J7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TIMM9Q9Y5J7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM9Q9Y5J7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms