Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTLL3Q9Y4R7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL3Q9Y4R7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms