Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y467

SALL2, Sal-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL2Q9Y467 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
SALL2Q9Y467 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SALL2Q9Y467 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SALL2Q9Y467 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SALL2Q9Y467 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SALL2Q9Y467 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SALL2Q9Y467 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SALL2Q9Y467 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SALL2Q9Y467 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SALL2Q9Y467 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SALL2Q9Y467 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SALL2Q9Y467 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SALL2Q9Y467 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SALL2Q9Y467 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
SALL2Q9Y467 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SALL2Q9Y467 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SALL2Q9Y467 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SALL2Q9Y467 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SALL2Q9Y467 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
SALL2Q9Y467 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SALL2Q9Y467 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SALL2Q9Y467 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SALL2Q9Y467 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SALL2Q9Y467 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SALL2Q9Y467 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SALL2Q9Y467 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SALL2Q9Y467 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SALL2Q9Y467 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SALL2Q9Y467 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SALL2Q9Y467 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SALL2Q9Y467 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SALL2Q9Y467 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SALL2Q9Y467 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SALL2Q9Y467 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SALL2Q9Y467 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SALL2Q9Y467 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SALL2Q9Y467 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SALL2Q9Y467 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SALL2Q9Y467 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SALL2Q9Y467 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SALL2Q9Y467 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SALL2Q9Y467 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SALL2Q9Y467 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SALL2Q9Y467 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms