Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED3Q9Y3Q3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.4 ms