Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZDHHC9Q9Y397 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZDHHC9Q9Y397 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZDHHC9Q9Y397 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ZDHHC9Q9Y397 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZDHHC9Q9Y397 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZDHHC9Q9Y397 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZDHHC9Q9Y397 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZDHHC9Q9Y397 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZDHHC9Q9Y397 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZDHHC9Q9Y397 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZDHHC9Q9Y397 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZDHHC9Q9Y397 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZDHHC9Q9Y397 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZDHHC9Q9Y397 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZDHHC9Q9Y397 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZDHHC9Q9Y397 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZDHHC9Q9Y397 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms