Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC4Q9Y296 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms