Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y289

SLC5A6, Sodium-dependent multivitamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A6Q9Y289 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A6Q9Y289 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms