Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC2Q9Y235 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
APOBEC2Q9Y235 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms