Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAF8Q9UPN6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAF8Q9UPN6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAF8Q9UPN6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF8Q9UPN6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF8Q9UPN6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF8Q9UPN6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF8Q9UPN6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF8Q9UPN6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF8Q9UPN6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF8Q9UPN6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF8Q9UPN6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF8Q9UPN6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF8Q9UPN6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF8Q9UPN6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF8Q9UPN6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF8Q9UPN6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF8Q9UPN6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCAF8Q9UPN6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCAF8Q9UPN6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAF8Q9UPN6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms