Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FZD1Q9UP38 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FZD1Q9UP38 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FZD1Q9UP38 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FZD1Q9UP38 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FZD1Q9UP38 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FZD1Q9UP38 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FZD1Q9UP38 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FZD1Q9UP38 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FZD1Q9UP38 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FZD1Q9UP38 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FZD1Q9UP38 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FZD1Q9UP38 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FZD1Q9UP38 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FZD1Q9UP38 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FZD1Q9UP38 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FZD1Q9UP38 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FZD1Q9UP38 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FZD1Q9UP38 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FZD1Q9UP38 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FZD1Q9UP38 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FZD1Q9UP38 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FZD1Q9UP38 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FZD1Q9UP38 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FZD1Q9UP38 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FZD1Q9UP38 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FZD1Q9UP38 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FZD1Q9UP38 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FZD1Q9UP38 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
FZD1Q9UP38 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FZD1Q9UP38 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FZD1Q9UP38 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms