Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP18Q9UMW8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
USP18Q9UMW8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
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