Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FZD4Q9ULV1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FZD4Q9ULV1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FZD4Q9ULV1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FZD4Q9ULV1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FZD4Q9ULV1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FZD4Q9ULV1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FZD4Q9ULV1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD4Q9ULV1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD4Q9ULV1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD4Q9ULV1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD4Q9ULV1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD4Q9ULV1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FZD4Q9ULV1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FZD4Q9ULV1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FZD4Q9ULV1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FZD4Q9ULV1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FZD4Q9ULV1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FZD4Q9ULV1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD4Q9ULV1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FZD4Q9ULV1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229 ms