Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDRG4Q9ULP0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDRG4Q9ULP0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms