Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MED23Q9ULK4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
MED23Q9ULK4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
MED23Q9ULK4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MED23Q9ULK4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MED23Q9ULK4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MED23Q9ULK4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MED23Q9ULK4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MED23Q9ULK4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MED23Q9ULK4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MED23Q9ULK4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MED23Q9ULK4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MED23Q9ULK4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MED23Q9ULK4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MED23Q9ULK4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MED23Q9ULK4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MED23Q9ULK4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MED23Q9ULK4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MED23Q9ULK4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MED23Q9ULK4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MED23Q9ULK4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MED23Q9ULK4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MED23Q9ULK4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MED23Q9ULK4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MED23Q9ULK4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MED23Q9ULK4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MED23Q9ULK4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MED23Q9ULK4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MED23Q9ULK4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MED23Q9ULK4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MED23Q9ULK4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MED23Q9ULK4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MED23Q9ULK4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MED23Q9ULK4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MED23Q9ULK4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MED23Q9ULK4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
MED23Q9ULK4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MED23Q9ULK4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MED23Q9ULK4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MED23Q9ULK4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MED23Q9ULK4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MED23Q9ULK4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MED23Q9ULK4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MED23Q9ULK4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MED23Q9ULK4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
MED23Q9ULK4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MED23Q9ULK4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms