Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3Q9UKS6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PACSIN3Q9UKS6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3Q9UKS6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms