Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms