Protein–RNA interactions for Protein: Q9P032

NDUFAF4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF4Q9P032 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF4Q9P032 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFAF4Q9P032 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF4Q9P032 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms