Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJC28Q9NX36 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
DNAJC28Q9NX36 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms