Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf109Q9NX04 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf109Q9NX04 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms