Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTN9

SEMA4G, Semaphorin-4G, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4GQ9NTN9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4GQ9NTN9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4GQ9NTN9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4GQ9NTN9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4GQ9NTN9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4GQ9NTN9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4GQ9NTN9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4GQ9NTN9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4GQ9NTN9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4GQ9NTN9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4GQ9NTN9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEMA4GQ9NTN9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms