Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL28Q9NRJ3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL28Q9NRJ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL28Q9NRJ3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL28Q9NRJ3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL28Q9NRJ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL28Q9NRJ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL28Q9NRJ3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL28Q9NRJ3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL28Q9NRJ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL28Q9NRJ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL28Q9NRJ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL28Q9NRJ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL28Q9NRJ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL28Q9NRJ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL28Q9NRJ3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL28Q9NRJ3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL28Q9NRJ3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL28Q9NRJ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL28Q9NRJ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL28Q9NRJ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL28Q9NRJ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms