Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C8orf4Q9NR00 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf4Q9NR00 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms